政府购买服务通常是政府作为委托方，社会组织作为受托方，两者之间是在契约基础上的委托代理关系。公益创投的委托方通常是捐赠者和投资者，包括政府、基金会、风投和私募公司、天使投资人和其他企业；投资对象为社会目的组织，不限于社会组织，还包括个人和社会目的驱动的商业企业。实施主体为公益创投组织，通常来源于私人部门、企业家或者私人股权资本，管理者具有非营利和私营部门的双重背景。虽然每个国家都有自己的形式和名称，但65%的欧洲公益创投以基金会、信托或慈善组织的形式存在，一些以公司、基金或双重结构的形式存在。
资金来源不同

政府购买服务的资金来源主要是中央和地方财政支出。公益创投的资金来源渠道比较多元化，可以有政府的公共资金，也包括基金会、风投和私募公司的投资，还包括社会公众的捐赠，欧洲公益创投联盟的一份报告显示：40%的公益创投资金来源于捐赠收入，其他来源于私募股权投资、风险投资、对冲基金、私人和公司。 
提供的支持不同

政府购买服务通常是提供固定金额的现金，资助社会组织在一定周期内完成服务项目。公益创投往往提供定制化的财务支持和其他形式的非财务支持。上述报告显示：公益创投为社会组织提供的财务支持中，72%的形式是补助，11%是股权和准股权，9%是以债务的形式提供；非财务支持则包括战略咨询、财务管理、法务、人力资源、IT服务等。             
回报的形式不同

政府购买服务只单纯要求实现社会影响。在强调社会效益优先的前提下，公益创投通常需要实现财务回报与社会影响的双重目标。